Información general
Los talleres se dictarán en forma online mediante la plataforma Zoom
Se otorgará certificado de participación con asistencia mínima a determinar por cada equipo docente
Si tiene dudas o comentarios escríbanos a cursos@a2b2c.org
Los talleres son arancelados. La tarifa de inscripción es única para socios y no socios de la A2B2C, profesionales de industria y academia, estudiantes y público en general.
Cursos
Análisis de Datos Genómicos en la Nube: Un Workshop breve con foco en SARS-CoV-2 y la plataforma Galaxy
Fecha: Lunes 8 y Martes 9 de Noviembre de 2021
Horario: De 9 a 13 hs. (GMT-3)
Docentes: Humberto Debat, Ariel Amadio, Franco Fernández, Carolina Torres, Máximo Rivarola, Sergio Gonzales, Diego Zapallo (INTA-CONICET, Argentina)
Costos de inscripción en Argentina: AR$ 1500 - Desde el exterior: U$D 20
El objetivo del workshop es introducir el uso de herramientas de código abierto e infraestructura pública para análisis transparentes y reproducibles de datos genómicos con foco en COVID-19.
El workshop es abierto y de nivel inicial para investigadores/becarios interesados en análisis de datos masivos en la nube.
El workshop estará orientado a introducir Galaxy (https://usegalaxy.org/), una plataforma web de código abierto para la investigación biomédica intensiva en datos. Los participantes se familiarizarán principalmente con el entorno digital Galaxy que permite a investigadores sin experiencia en informática realizar análisis computacionales a través de la web.
Con foco en COVID-19, el workshop estará orientado a desarrollar capacidades básicas en el análisis y la gestión de datos del SARS-CoV-2, incluida la carga y procesamiento de datos de secuenciación viral, la generación de consensos genómicos, identificación y caracterización de variantes y algunos análisis evolutivos básicos.
Al finalizar el taller los participantes tendrán una idea general de las posibilidades de análisis de datos masivos en la nube con infraestructura pública y gratuita, no solo para SARS-CoV-2 sino también para cualquier otra fuente de datos ómicos en ciencias biomédicas.
Introducción a R y Bioconductor para análisis genómicos
Fecha: Lunes 8 y Martes 9 de Noviembre de 2021
Horario: De 9 a 16 hs. (GMT-3) (clases sincrónicas de 9 a 11 hs. y de 14 a 16 hs.)
Docentes: Carla Filippi (FAGRO-UdelaR, Uruguay), Pamela Villalba (INTA-CONICET, Argentina)
Costos de inscripción en Argentina: AR$ 1500 - Desde el exterior: U$D 20
Este workshop introductorio está destinado principalmente a becarios doctorales de iniciación, que buscan dar sus primeros pasos en el uso de R para análisis de datos genómicos.
El workshop es abierto y de nivel inicial para investigadores/becarios interesados en análisis de datos masivos en la nube.
Además de introducir las funciones básicas de R y Bioconductor, se aplicarán herramientas específicas para este tipo de datos.
Se explorará también el vínculo de R con bases de datos genómicas públicas, como Ensembl y Ensembl Genomes.
Visualización de estructuras tridimensionales de proteínas y fundamentos de docking molecular
Fecha: Lunes 8 de Noviembre de 2021
Horario: De 14 a 18 hs. (GMT-3)
Docentes: Pablo Lorenzano Menna, Patricio Chinestrad (UNQ-CONICET, Argentina)
Costos de inscripción en Argentina: AR$ 1500 - Desde el exterior: U$D 20
Este workshop cubre herramientas básicas para la visualización de estructuras terciarias de proteínas y la simulación de su interacción con otras moléculas.
Se explorará el uso de bases de datos públicas de estructuras cristalográficas de proteínas como Protein Data Bank.
Se introducirá el uso del software Pymol para la visualización y análisis de estructuras cristalográficas de proteínas.
Se presentarán fundamentos de docking molecular entre compuestos orgánicos y proteínas (docking proteína-ligando).
Se guiará en el uso del software Autodock Vina para la determinación de la energía de interacción entre proteínas y ligandos de bajo peso molecular, así como el análisis de resultados de experimentos de docking usando el software Autodock Tools.
Estadística con Python
Fecha: Martes 9 de Noviembre de 2021
Horario: De 14 a 18 hs. (GMT-3)
Docentes: Leandro M. Sommese (UNQ-CONICET, Argentina)
Costos de inscripción en Argentina: AR$ 1500 - Desde el exterior: U$D 20
Este workshop ofrece una introducción al análisis estadístico orientado a la investigación en ciencias biológicas con el lenguaje de programación Python.
Presenta al estudiante los fundamentos y el uso de conceptualizaciones estadísticas para el diseño de experimentos y la manipulación de datos experimentales en ciencias.
El curso propone incorporar conceptos generales de programación en Python como herramienta computacional relevante para el estudio de sistemas biológicos.
Introducirá el uso de bibliotecas de Python específicas para el tratamiento de datos biológicos y para la presentación de datos para publicaciones científicas. Abordará la necesidad y utilidad de la Estadística como herramienta en el ejercicio profesional.
Se desarrollarán criterios prácticos para aplicar adecuadamente las técnicas de la Estadística Inferencial, seleccionar el estadístico más apropiado para cada tipo de inferencia inductiva, calcular el tamaño adecuado de muestra y aplicar las técnicas de Test de Hipótesis y las Pruebas de Estadística no paramétrica.